Chuỗi giá trị hàng hóa là mô hình hiệu quả trong sản xuất nông nghiệp đang thu hút các doanh nghiệp và HTX tích cực tham gia liên kết. Tuy nhiên, để phát huy được vai trò của HTX trong liên kết chuỗi giá trị nông sản còn không ít vấn đề cần giải quyết, đặc biệt là việc mở rộng quy mô thành viên để tăng diện tích sản xuất, từ đó có vùng nguyên liệu lớn, đồng đều về tiêu chuẩn chất lượng...
Để HTX tồn tại và phát triển, mỗi HTX phải có kế hoạch, phương án sản xuất kinh doanh phù hợp. Vậy nhưng do cả lý do khách quan và chủ quan, nhiều HTX vẫn sản xuất nhưng chưa biết kết quả ra sao. Điều này khiến sản phẩm hàng hóa của HTX khó đứng vững trên thương trường, HTX cũng rơi vào tình trạng bị động, chịu nhiều rủi ro.
Công nghệ bảo quản còn hạn chế, thiếu vùng nguyên liệu sản xuất đạt chuẩn… là những 'điểm yếu' mà hầu hết hợp tác xã, doanh nghiệp nông sản đang gặp phải khi muốn 'mang chuông đi đánh xứ người'.
Kết thúc năm 2018, xuất khẩu rau quả tiếp tục đạt kỷ lục khi cán đích hơn 3,5 tỷ USD. Điều này thúc đẩy toàn ngành đặt mục tiêu 4 tỷ USD cho năm 2019. Song 9 tháng năm 2019, xuất khẩu rau quả giảm 4,3% so với cùng kỳ. Chuỗi giảm kéo dài từ tháng 5 và dự báo cuối năm nay ngành rau quả khó về đích theo kế hoạch.