Bộ GTVT yêu cầu các Ban QLDA giải quyết dứt điểm việc giải phóng mặt bằng; linh hoạt trong việc áp dụng một số giải pháp đẩy nhanh công tác này như phương án tạm cư, hỗ trợ địa phương di dời nhà cửa… sớm hoàn thành sửa chữa tuyến đường sắt Bắc-Nam.Đơn vị thi công đang thực thi công việc sửa chữa tuyến đường sắt Bắc-Nam.Dự án Vinh – Nha Trang, được chủ đầu tư nghiệm thu hoàn thành 4/7 gói thầu (gói thầu số 9, 10, 22, 23); Gói thầu số 12 đã thi công hoàn thành cơ bản (trừ phần phát sinh bổ sung sửa kiến trúc tầng trên đường sắt trong hầm).
Các ban QLDA chịu trách nhiệm trước Bộ GTVT nếu không hoàn thành dự án 7.000 tỷ đường sắt Bắc-Nam đúng thời hạn hợp đồng.
Vướng mắc trong công tác giải phóng mặt bằng (GPMB), các ban QLDA chưa thực hiện đầy đủ trách nhiệm của chủ đầu tư cũng như năng lực thi công của một số nhà thầu còn hạn chế khiến dự án đường sắt 7.000 tỷ chậm tiến độ.
Khó khăn trong giải phóng mặt bằng; các ban quản lý dự án chưa thực hiện đầy đủ vai trò, trách nhiệm của chủ đầu tư; năng lực thi công của một số nhà thầu còn hạn chế;...đã khiến dự án đường sắt gói 7.000 tỷ đồng vốn trung hạn 2016 - 2020 chưa thể về đích.