Việc không kiểm soát hiệu quả các đối tượng kiểm dịch thực vật ngay từ vùng trồng và cơ sở đóng gói dẫn đến tình trạng các lô hàng không đáp ứng được quy định của Trung Quốc và làm mất uy tín hàng hóa xuất khẩu từ Việt Nam, thậm chí có nguy cơ mất thị trường xuất khẩu quan trọng này.
Trước 'cơn sốt' của giá sầu riêng, có tình trạng một số doanh nghiệp, thương lái và cả 'cò đất' không hiểu biết đi bẻ lái sang môi giới sầu riêng đã làm xáo trộn thị trường, xúi nông dân bẻ kèo… dẫn đến những hậu quả đứt gãy chuỗi liên kết, ảnh hưởng tới uy tín và chất lượng của cả ngành hàng tỷ đô này.